Так-то, море унести может и без шторма. Они могли поплыть куда-то на лодке (у них была лодка?) и утонуть (там при строительстве уже тонули), или, действительно, один мог куда-нибудь упасть, провалиться, остальные полезли спасать и сами погибли... Это всё возможно.
Но! Странность случая именно в шторме и в записях в журнале. Перепутали дни, когда был шторм? Ладно, пусть. Но вот это: "Плакали и молились, нет выхода". Ну, что плакали и молились, это понятно, бушует стихия, люди тогда были намного более религиозны, и т.д., но почему "нет выхода"? Это же просто шторм, они наверняка уже не один пережили. Три взрослых здоровых опытных мужика на высокой скале в крепкой башне, у них есть еда, вода, они точно знают, когда должен прийти корабль, какой им выход нужен был, откуда, куда? Шторм рано или поздно закончится, и всё будет нормально. Они же не на необитаемом острове жили. Значит, был не "просто шторм", а какой-то особенно страшный.
И смущает, что исчезли два плаща и две пары сапог. А третий без плаща и сапог вышел? Психоз какой-то накрыл? Вскочил, перевернул стул, выбежал на улицу... Остальные двое такие: "Ну что ж, пойдём искать его..." Но не так спешили, как он, потому оделись, как полагается, двери заперли и пошли.
Мне нравится теория про инфразвук. Ну, если искать научное объяснение, а не брать в расчёт всяких мëртвых эльфов.